Pondok Pesantren Al-Qomariyyah Bani Husen Cikolam berdiri pada tahun 1975 oleh K.H. AHMAD AFFANDI (alm) bin K.H HUSEN (alm) tepatnya di Dusun Jagamulya Rt.04 Rw.05 Desa Rajadesa Kecamatan Rajadesa Kabupaten Ciamis Jawa Barat, yang kemudian pada tahun 1999 diteruskan oleh putra beliau yakni K MUMU MU'ALIM. Pondok Pesantren Al-Qomariyah merupakan lembaga pengajaran islam dengan mode salaf ( tradisional ) murni.
Perjalanan Pondok Pesantren dari periode ke periode selanjutnya senantiasa memperlihatkan peningkatan yang dinamis dan signifikan , usaha -usaha ke arah pembaharuan dan modernisasi memang sebuah konsekwensi dari sebuah dunia yang modern. tetapi, tetap harus memiliki batasan-batasan yang kongkrit. pembaharuan dan modernisasi tidak boleh merubah atau mereduksi orientsi dan idealisme pesantren. berangkat dari pemikiran tersebut, melalui istikharah dan ijtihad Pimpinan Umum Pondok Pesantren dan hasil musyawarah denga para Dewan Kyai , maka berdirilah SMK AL-MA'ARIF Al-MUZAYYIN.